Το Ιατρικό Πανεπιστήμιο – Βάρνα ιδρύθηκε το 1961 στην πόλη της Βάρνας. Αρχικά θεωρήθηκε ως Ανώτατο Ιατρικό Ινστιτούτο και μόλις το 1995 μετονομάστηκε σε Ιατρικό Πανεπιστήμιο-Βάρνα μετά από απόφαση της Εθνοσυνέλευσης. Το 2002, πήρε το όνομά του από τον καθηγητή. Ο Δρ ParaskevStoyanov, ο οποίος έθεσε τα θεμέλια της Πρώτης Βουλγαρικής Χειρουργικής Σχολής, καθώς και ενόςΠαιδικού Θαλάσσιου Σανατόριου για τη Φυματίωση των Οστών και των Αρθρώσεων, το οποίο ήταν το μοναδικό στο είδος του στη Βαλκανική Χερσόνησο.

Το Ιατρικό Πανεπιστήμιο-Βάρνα είναι ένα από τα πρώτα μέλη του Δικτύου Πανεπιστημίων της Μαύρης Θάλασσας (BSUN). Το 2004, στην Ολλανδία το πανεπιστήμιο εγκρίνεται ως πλήρες μέλος της Ευρωπαϊκής Ένωσης Πανεπιστημίων (EUA). Το Ιατρικό Πανεπιστήμιο είναι το μόνο στη Βουλγαρία που εισήγαγε το 2008 ένα μοντέλο του Ευρωπαϊκού Ιδρύματος για τη Διαχείριση της Ποιότητας (EFQM). Το MU-Varna διατηρεί συνεργασίες με περισσότερα από 80 πανεπιστήμια και εκπαιδευτικά ιδρύματα από 40 χώρες σε 5 ηπείρους. Από το 2001 έως το 2007 το MU – Varna διοργάνωσε ανταλλαγές φοιτητών και καθηγητών στο πλαίσιο του προγράμματος «Socrates-Erasmus». Από το 2010 στις κλινικέςβάσεις του MU – Βάρνα πραγματοποιείται ανταλλαγή φοιτητών για καλοκαιρινές πρακτικές με το Πρώτο Κρατικό Ιατρικό Πανεπιστήμιο της Μόσχας «I. M. Sechenov» και το Βορειοδυτικό Κρατικό Ιατρικό Πανεπιστήμιο «I. I. Mechnikov» στην Αγία Πετρούπολη.

Ιατρικό Πανεπιστήμιο – Η Βάρνα είναι από τα πρώτα πανεπιστήμια στην Ευρώπη, προσελκύοντας μεγάλο αριθμό ξένων φοιτητών. Περισσότεροι από 8.351 Βούλγαροι φοιτητές και 977 ξένοι φοιτητές από 45 διαφορετικές χώρες έχουν αποφοιτήσει από την ίδρυσή του. Με την ανάπτυξή του όλα αυτά τα χρόνια, το Ιατρικό Πανεπιστήμιο – Βάρνα διατηρεί τέσσερα νοσοκομεία, που ιδρύθηκαν τις δεκαετίες του ’70 και του ’80: Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο “St.Marina”- το μεγαλύτερο διαγνωστικό και συμβουλευτικό νοσοκομείο στην περιοχή. Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο “St.Anna”; Εξειδικευμένο Νοσοκομείο για Ενεργό Θεραπεία στη Μαιευτική και Γυναικολογία. Εξειδικευμένο Νοσοκομείο για την Ενεργό Θεραπεία Οφθαλμικών Παθήσεων.

Το Πανεπιστήμιο προετοιμάζει ειδικούς στους τομείς της Ιατρικής και της Υγείας, της Οδοντιατρικής και της Φαρμακευτικής για την απόκτηση πτυχίων Bachelor, Master, Professional Bachelor. Τα διπλώματα που απονέμονται από το πανεπιστήμιο αναγνωρίζονται σε όλες τις χώρες της Ευρωπαϊκής Ένωσης. Το πανεπιστήμιο έχει θυγατρικές στις πόλεις Shumen, Sliven και VelikoTarnovo.